水塔清洗為建築物用水設備最重要的維護工作，至少每半年應水池水塔清洗一次（得視水質情況彈性調整）。清洗時除徹底清除水池、水塔之沉澱物與雜質，且同時檢修各項有關設備。
一般從自來水廠淨化後的自來水皆能符合飲用水水質標準，但卻很少能直接從家中水龍頭中飲用。這是因為水塔維護大都不理想，是水質污染最容易發生問題的一環，可見水塔清洗仍有改善的空間。根據檢驗報告，由於常久不曾清洗，自來水管藏有大量大腸桿菌和砷、汞、鐵、錳等重金屬，隨著水流危害人體健康。
蓄水池、水塔常見污染原因，如長期未清洗，淤積污垢鐵鏽、甚至產生綠藻發生臭味。飲用水與消防並用，因逆止閥故障使地下消防水池進入水塔造成水池污染。馬達直接由自來水配水管網抽水，若停止時，因虹吸作用容易吸入外部污染物質。因此必須定期清洗水塔以維持飲用水的品質。